A felszíni vizek állapotának megőrzése kiemelten fontos feladat. A Balaton élővilága különösen érzékeny a növekvő átlaghőmérséklet, gyakoribbá váló szélsőséges időjárás, a part növekvő beépítettsége és a nyári idegenforgalom okozta stresszel szemben.