Bár a Crohn-betegség elsősorban az emésztőrendszert érinti, fontos felismerni, hogy számos más szervrendszerre is hatással lehet. Mivel ezek a tünetek gyakran korábban jelentkeznek, mint az emésztőszervi panaszok, segíthetnek a betegség korai felismerésében és a kezelés megkezdésében.